深圳市E字开头的公交车线路有很多，其中包括E1、E2、E3等线路，这些线路的发车时间也因线路不同而有所差别。

以E1线路为例，该线路是一条连接深圳市福田区和宝安区的快速公交线路，日常发车时间为早上6点至晚上10点，发车间隔约为10至15分钟。在高峰期和节假日，发车间隔会缩短至5至10分钟，以满足市民的出行需求。

E2线路则是一条连接深圳市南山区和罗湖区的公交线路，日常发车时间为早上6点至晚上10点，发车间隔约为10至20分钟。在节假日和特殊活动期间，发车间隔会缩短至5至10分钟。

而E3线路是一条连接深圳市龙华区和罗湖区的公交线路，日常发车时间为早上6点至晚上10点，发车间隔约为10至20分钟。在节假日和特殊活动期间，发车间隔会缩短至5至10分钟。

总的来说，深圳市E字开头的公交车线路日常发车时间都集中在早上6点至晚上10点之间，发车间隔时间也较为稳定，市民可根据自身出行需求选择合适的线路和时间。同时，在节假日和特殊活动期间，市民需要提前了解公交线路的发车时间和间隔，以避免出行不便。