猪三角洲病毒(PDCoV)研究现状
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作者:龚商羽
摘要:近年来,猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪三角洲病毒(PDCoV)在多个国家相继暴发,给养猪业造成了巨大的经济损失,目前仍然是一个严峻的挑战。猪三角洲病毒(PDCoV)隶属于冠状病毒科三角花叶病毒属,它是一种新兴的猪肠道病毒,在哺乳仔猪中引起腹泻、呕吐、脱水和死亡,死亡率为40%~80%。本文从三角洲病毒的病原学、传染源、传播途径、致病性和检测技术等方面进行阐述,以便为制定有效的防控措施提供依据。
关键词:猪流行性腹泻病毒(PEDV);猪三角洲病毒(PDCoV);检测技术
猪三角洲病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)是一种新型的肠道致病菌,可引起新生仔猪腹泻,给亚洲和北美洲的养猪业造成额外的经济负担。最早的PDCoV鉴定和报告是在2012年由Woo等人在香港完成的。但在2014年美国暴发疫情后才开始受到关注。随后,它迅速蔓延到美国、韩国、加拿大、日本、越南和泰国,给猪肉行业带来巨大的经济损失。在我国,PDCoV在河南省和广东省的患病率分别为36.43%和21.7%。
1 病原学
PDCoV是一种包被的阳性感单链RNA病毒,基因组约为25.4kb,是已知冠状病毒中最短的基因组。ORF1a和ORF1ab这两个开放阅读框占据了其基因组的近2/3,分别编码两种聚合酶蛋白pp1a和pp1ab,它们被蛋白质水解成15种成熟的非结构蛋白。基因组的另1/3编码4种结构蛋白,穗蛋白(S蛋白)、包膜蛋白(E蛋白)、膜蛋白(M蛋白)和核蛋白(N蛋白)。PDCoV基因组中还发现了3种辅助蛋白NS6(位于M和N基因之间)和NS7/NS7a(位于N基因内)。已知PDCoV株的全基因组序列是相对保守的,具有97.1%~99.9%的核苷酸同源性。
2 传染源与传播途径
消化道传播是PDCoV的主要传播方式,最近的报道发现,PDCoV通过间接接触感染仔猪而传播,表明呼吸道可能是PDCoV感染的次要目标。此外,有研究发现对照仔猪随着PDCoV CHN-SC2015感染而出现轻度腹泻,进一步支持PDCoV可以通过呼吸道传播的观点。基于全基因组的系统发育分析表明,PDCoV可能起源于麻雀冠状病毒。此外,Lau等人。发现来自鹌鹑的新型禽流感病毒QuaCoV UAE-HKU30与猪冠状病毒HKU15和麻雀冠状病毒HKU17属于同一冠状病毒种类,为禽-猪传播提供了一个例子。
3 致病性
冠状病毒S蛋白突变被认为是PDCoV病毒致病和宿主嗜性改变的关键因素。基于PDCoV株CHN-SC2015全基因组的序列分析显示,S基因中存在3-nt缺失;该缺失在其他中国分离株中发现,但在美国、日本、韩国或东南亚的分离株中没有发现,表明这些PDCoV株之间毒力差异的机制。
近年来,PDCoV对仔猪的致病性已成为研究的热点。PDCoV感染、腹泻、呕吐、脱水和死亡的临床特征与其他肠道致病性猪冠状病毒感染(如PEDV和TGEV)无明显区别。有研究用106.35tcid50/mL细胞培养适应病毒对5日龄猪进行了PDCoV株CHN-SC2015的致病性研究。在5dpi时,来自受试仔猪的胃肠组织显示出明显的损伤,表明肠道是病毒复制的主要部位。
4 检测技术
在PEDV和PDCoV爆发之前和期间,快速诊断对于实施有效的控制策略至关重要。便携式POCKIT设备上的绝缘等温PCR(iiPCR)便于用户进行现场病原体检测。有研究将针对M基因的单重PEDV-RT-iiPCR、单重PDCoV-RT-iiPCR和双重PEDV/PDCoV实时RT-PCR(rRT-PCR)商业试剂与先前发表并用作参考PCRs的基于N基因的PEDV-rRT-PCR和基于M基因的PDCoV-rRT-PCR进行了比较。所有PCR检测均具有高度特异性,且不与其他猪肠道病原体发生交叉反应。
5 疫苗开发
PDCoV S蛋白与宿主细胞受体相互作用,介导病毒包膜与宿主细胞膜的融合是病毒進入的关键步骤。许多研究表明,S蛋白的突变影响病毒的趋化性和致病性。例如,猪呼吸道冠状病毒(PRCV)的S基因缺失改变了猪呼吸道冠状病毒的取向和致病性。Sun等人发现PEDV野生株PEDV-LY4-98的S基因突变导致对新生仔猪的致病性增加。此外,S蛋白具有高度的免疫原性,这使得它成为开发有效的冠状病毒疫苗的有用靶点。
作者简介:龚商羽(1981-),女,中级兽医师。从事重大动物疫病的预控研究。
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