圆底烧瓶和平底烧瓶是实验室中常用的两种烧瓶，它们的形状不同，因此在使用时也有一些区别。

首先，圆底烧瓶的底部是圆形的，而平底烧瓶的底部是平的。这意味着圆底烧瓶需要使用烧瓶架和三角支架进行支撑，以确保其稳定性，而平底烧瓶则可以直接放在实验台上。因此，在实验室中，平底烧瓶更加方便使用，同时也更加安全。

其次，圆底烧瓶可以更好地均匀加热液体，因为其底部的形状可以促进液体的对流。而平底烧瓶则需要使用磁力搅拌器等工具来实现液体的搅拌和均匀加热。

最后，圆底烧瓶的结构更加牢固，可以承受更高的压力和温度，因此适合用于高温高压实验。而平底烧瓶则更加容易破裂，因此不适合用于高压实验。

综上所述，圆底烧瓶和平底烧瓶在使用时有一些区别，需要根据实验的具体要求选择适当的烧瓶。