东京是日本的首都，也是全国人口最多的城市，但并不是日本最大的城市。

在日本，城市的大小通常是以市区面积为依据。根据这个标准，东京市区的面积约为2,190平方公里，是日本最大的城市。但是，如果以都市区或大都市圈的范围来看，东京就不是最大的城市了。

据统计，日本最大的城市是大阪。大阪市区的面积虽然只有约225平方公里，但大阪都市区的范围涵盖了兵库县、京都府、奈良县和滋贺县等周边地区，总面积达到了约13,000平方公里。这个范围内的人口也远超过东京市区。

因此，虽然东京市区的面积最大，但在整个都市区或大都市圈的范围内，东京就不是日本最大的城市了。