东直门到北京南站的距离大约是16公里左右，根据交通状况和路况不同，乘坐不同的交通工具所需时间也会有所不同。

如果选择乘坐地铁，可以从东直门地铁站搭乘地铁2号线（内环）前往北京南站，全程需要大约30分钟左右，其中有一次换乘，需要在车公庄站转乘地铁4号线（大兴线），然后在北京南站下车。

如果选择乘坐出租车，根据交通状况和路况不同，预计需要大约40分钟左右的时间到达北京南站。出租车费用大约在50元左右。

此外，如果您选择自驾前往，道路通畅的情况下，大约需要30分钟左右的时间到达北京南站。但是，由于北京市区交通拥堵情况较为普遍，可能需要更长的时间。

总体而言，从东直门到北京南站，乘坐地铁需要30分钟左右，乘坐出租车或自驾需要40分钟左右，具体时间还需要根据交通状况和路况进行实时调整。