农村自建房卫生间的方位选择非常重要，不仅关系到舒适度，还关系到卫生和环保。那么，在哪个方位建卫生间最好呢？

首先，卫生间应该远离居住区，以避免臭气和污水污染周围环境。因此，在农村自建房时，卫生间应该建在房屋的后面或侧面，这样能够有效地与居住区隔开。

其次，卫生间应该建在阳光充足、通风良好的地方。这样不仅可以保持卫生间干燥，避免霉菌滋生，还可以让室内空气流通，减少异味和细菌的滋生。因此，在选择卫生间的方位时，应该优先考虑朝向南或西南的位置。

此外，卫生间的建筑结构也非常重要。在建造卫生间时，应该尽可能地采用环保材料，同时要注意通风和防水。特别是在地下水位高的地区，还需要采取防渗措施，以避免地下水渗入卫生间，影响使用和健康。

综上所述，农村自建房卫生间的方位应该选在房屋的后面或侧面，朝向南或西南的位置最佳。此外，卫生间的建筑结构和环保材料也非常重要，应该注意通风、防水和防渗措施，以保证使用和健康。