白寇和肉蔻是中药材中非常常见的两种，它们都有着很好的药用价值，但是功效区别还是比较明显的。

白寇，又称为苦参，是一种常见的中药材，主要生长在我国北方地区。白寇性寒苦，有清热解毒的作用，可以用于治疗热毒病疮、痈肿疮疖等疾病。同时，白寇还有一定的镇痛作用，可以用于治疗头痛、牙痛等疾病。此外，白寇还有一定的消炎作用，可以用于治疗皮肤疾病和消化系统疾病。

肉蔻，又称为莪术，是一种常见的中药材，主要生长在我国南方地区。肉蔻性温辛，有温中行气的作用，可以用于治疗脾胃虚寒、消化不良、胃痛等疾病。同时，肉蔻还有一定的镇痛作用，可以用于治疗痛经、风湿疼痛等疾病。此外，肉蔻还有一定的抗菌作用，可以用于治疗皮肤疾病和呼吸系统疾病。

综上所述，白寇和肉蔻虽然都有一定的清热解毒和镇痛作用，但是它们的主要功效还是不同的。白寇适用于治疗热毒病疮、痈肿疮疖等疾病，肉蔻适用于治疗脾胃虚寒、消化不良、痛经、风湿疼痛等疾病。在使用时，应根据具体情况选择合适的中药材。