学生申请认定贫困的理由填写应该从以下几个方面入手：

首先，学生可以从家庭收入方面入手。可以在表格中填写家庭人均收入低、家庭经济困难等原因，说明家庭经济状况。同时，如果家庭中有特殊情况，如失业、患病等，也可以在表格中说明，以便更好地体现家庭经济状况。

其次，学生可以从家庭负担方面入手。可以在表格中填写家庭中有多少人需要供养，家庭中有多少人需要接受教育等信息，说明家庭的负担情况。同时，如果家庭中有残疾人、老人等需要特别照顾的人员，也可以在表格中说明，以便更好地体现家庭负担情况。

最后，学生可以从教育机会方面入手。可以在表格中填写学生自己的学习成绩、课外活动、获得的奖项等信息，说明学生在教育机会方面的不足。同时，如果学生所在的学校教育资源相对匮乏，或者学生所在的家庭无法提供良好的学习环境等，也可以在表格中说明，以便更好地体现学生在教育机会方面的不足。

在填写申请认定贫困的理由时，学生需要注意以下几点：

一是要实事求是，不夸大不缩小。表格中填写的内容必须真实可信，不得夸大或者缩小事实，以免误导审核部门，影响申请结果。

二是要注重语言的准确性和规范性。表格中填写的内容必须遵循语言的准确性和规范性，要注意用词得当，不得使用口语化或者俚语化的语言表达。

三是要注意申请材料的完整性。申请认定贫困的理由填写是申请材料中的重要部分，需要与其它申请材料相互呼应，确保申请材料的完整性和一致性。

总之，学生在填写申请认定贫困的理由时，需要全面、客观地反映自己家庭经济状况、负担情况和教育机会等方面的不足，以便审核部门更好地了解学生的实际情况，做出公正的审核决定。