主营业务收入是指企业在主营业务活动中所获得的收入，是企业经营活动的重要组成部分。在会计核算中，主营业务收入应该按照会计准则和相关法律法规的规定进行处理。那么，主营业务收入期初有余额吗？如何填写呢？

首先，根据会计准则的规定，主营业务收入的确认原则是“收入已经发生并且能够计量”。这就意味着，只有当企业确实获得了相应的收入，并且可以对其进行计量，才能确认为主营业务收入。因此，如果主营业务收入在期初有余额，那么这个余额必须是在上一期已经确认的收入。

其次，如果主营业务收入期初有余额，那么在填写财务报表时，应该将这个余额列入期初的主营业务收入中。具体来说，应该在资产负债表上的“应收账款”或“应收票据”等账户中记录这个余额，同时在利润表上的“主营业务收入”项目中填写期初余额的金额。

最后，需要注意的是，如果主营业务收入期初有余额，那么在填写财务报表时，还需要将这个余额与当期的主营业务收入进行区分。具体来说，应该在利润表上的“主营业务收入”项目中，分别列出期初余额和当期收入的金额，以便于财务分析和决策。

综上所述，主营业务收入期初有余额的处理方法是将余额列入期初的主营业务收入中，并在填写财务报表时与当期收入进行区分。这样可以有效地反映企业的经营情况，为财务分析和决策提供有力的支持。