会计机构负责人是否可以算作副财务总监，这是一个常见的问题。首先，需要明确的是，会计机构和财务部门虽然都是与财务相关的部门，但它们的职能和责任是有所不同的。

会计机构主要负责处理公司的财务数据，为公司提供准确的财务报表，确保公司的财务信息的准确性和合规性。而财务部门则负责企业的财务管理和决策，包括制定财务策略、管理资金、预算、投资等。

基于以上区分，会计机构负责人并不具备财务管理方面的职责和权限，因此不能算作副财务总监。副财务总监需要具备丰富的财务管理经验和专业知识，能够制定和执行企业的财务战略和计划，协助财务总监进行日常管理工作。因此，会计机构负责人虽然在公司的财务管理中具有重要的作用，但并不能代替副财务总监的职责。

总之，会计机构负责人和副财务总监虽然都是与财务相关的职位，但职责和权限是有所不同的。在企业的财务管理中，需要明确各个职位的职责和权限，以便更好地发挥各自的作用，为企业的发展提供有力的支持。